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冬虫夏草属于昆虫和真菌的混合体，其体内的很多有效物质都是大分子，如蛋白质、核苷等，用水泡后只能有少部分有效物质溶解到水中，饮用后药效并不理想。即使最后将泡软的虫草吃下去，人体也不能完全消化吸收。只有通过足够长时间的水煮或酒的浸泡，使有效成分充分溶解出来，才能利于人体的吸收。而人参、枸杞子等均为植物，其中的小分子成分在水中较易溶出，泡水饮用后人体可以吸收大部分有效成分。
另外，冬虫夏草表面会附着很多寄生虫、真菌孢子，直接把这些东西吃进肚子，会影响到人体的健康。如果只是用普通方法水洗后再用开水浸泡，冬虫夏草表面寄生的这些东西并不能去除干净。只有经过较长时间的煮沸或者用酒浸泡，才能真正保证安全。
冬虫夏草最好的服用方法主要有3种：水煎、煮汤以及泡药酒。水煎，时间一般为40分钟至1小时，如果处方中还有其他中药，一般将冬虫夏草单独煎，以免其有效成分被药渣吸附而浪费了。煮汤，一般将冬虫夏草和老鸭一起用小火炖，时间为1～2小时。泡药酒，将冬虫夏草放入白酒或黄酒中浸泡一段时间后饮用。不管上述哪种方法，最后都可以将冬虫夏草吃掉。
中医学认为，冬虫夏草性平、味甘，归肺、肾二经，具有益肾壮阳、补肺平喘、止血化痰的功效。适用于肺肾两虚、精气不足、咳嗽气短、自汗盗汗、腰膝酸软、阳痿遗精等病症。但它不是万能补药，尤其对于慢性病患者来说，道听途说地服用冬虫夏草药膳，反而会对健康不利。