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数万年前，在人类还没有经历工业革命，没有发明金属冶炼，甚至还没有开始农耕生活的时候，我们的祖先就已经和灰狼形成了一种互惠的关系。从那个时候开始，两个种族就一直生活在一起，影响着彼此。渐渐的，狼的身体构造和脾气秉性都发生了改变。它们的头骨、牙齿、爪子都变小了，耳朵垂了下来，不再具有极强的攻击性，不再令人恐惧，和人类更加亲近，甚至开始能够识别人类的面部表情，最终进化成了今天的狗。
而对于人类，今天，狗已经变成了生活中最熟悉，甚至最亲密的一部分。微博、微信、各种社交平台上随处可见各种关于狗狗的帖子。狗是第一个被人类驯化的物种，比猫、禽类、各种大型牲畜都要早很多年。可以说，狗见证了人类的崛起，见证了人类走向文明的过程。
从灰狼到土狗，狗子一路和人类走来，见证了人类历史的发展，并且在其中扮演了重要的角色。
虽然知道狗是从狼进化来的，但是对于什么时候，在哪里，以及，怎么进化的这些问题，科学家却争论了很多年，直到现在也没有定论。有人说狗是3万年前被驯化的，有人说是1万年前；有人说狗起源于欧洲，有的人说狗起源于中亚或者东亚；有的人认为是人类首先将狼群驯服，然后一点点地驯化了它们，有的人则认为狼帮助人打猎，然后得到食物作为奖赏，在这个过程中慢慢地被驯化。
为什么会有这么多说法呢？原因是狗被驯化了很长时间。在这个过程中它们和狼，还有不同的狗的品种之间，进行了数不清次数的的杂交（狗子你是有多乱啊）。所以现代狗的基因组中很多基因有着完全不同的来源。至于每一个基因是什么时候被添加进狗的基因组里，又是怎样被添加、以什么顺序被添加进去的？研究人员却完全没有头绪。
一条爱尔兰的古代狗先讲了个故事
爱尔兰东北面有一个源自新石器时代的史前坟墓，叫做纽格莱奇墓，是爱尔兰最为著名的史前坟墓之一。距今大约4800年前，生活在这里的人类已经开始了农耕生活。科学家在这里发现了一只狗的颞骨化石。或许，那个时候，狗就已经成为着这些人类生活中不可缺少的一部分。颞骨是哺乳动物头部的一块骨头，也是身体中最坚硬的一块骨头之一。因为坚硬，颞骨可以很好的保存动物体的DNA。如果用身体其他部分的骨头化石提取DNA的话，因为大部分基因组DNA已经被细菌分解了，所以最后只能分离到很少的化石样品DNA。但是，如果用颞骨提取DNA的话，尽管经过了这么多年，能够分离出来的DNA里有80%都来自颞骨的主人，并且，都是保存完整的DNA。
2016年，牛津大学的进化遗传学家劳伦特·弗朗茨（Laurent Frantz）就从纽格莱奇墓里发现的这块颞骨里，提取出了完整的狗的DNA，并且测序了整个基因组。劳伦特还从另外59只狗的化石样品中提取了线粒体的DNA。这59个样品来自距今3000年到14000年的欧洲狗化石样品。通过对比化石DNA样品和现代狗、现代狼的基因组，劳伦特提出，现代狗可能有两个起源。
劳伦特的假说是，距今数千年之前，在欧亚大陆的西端，人类开始驯化灰狼。渐渐的，灰狼演化成了狗。同样的事情也发生在欧亚大陆的东端。不过两端的人们都并不知道另一端发生了什么。后来的青铜时代，一些生活在欧亚大陆东部的人类开始向西部迁徙。当他们到达欧洲西端的时候，也带去了来自“神秘东方”的狗。这些来自东方的狗似乎有着异常强大的基因。在和西方狗长期杂交过程中，东方狗的基因变成了主流基因。
但是这个说法也遭到了一些质疑。最主要的质疑的是这个假说缺少相关化石的证据。另外，支撑假说的整个实验分析，都建立在一个化石样品的基因组上，模型的确定性需要更多的样品来支持。
狗子们到底是怎么从狼进化来的，似乎还是一个没有结论的争论。
两条德国的古代狗又讲了另一个故事
出于对这个问题的好奇，来自纽约斯托尼布鲁克分校的研究团队做了进一步的研究。这一次，研究人员增加了实验中化石样品的数量。除了囊括之前爱尔兰纽格莱奇墓的样品之外，这次的研究还包括了两个在德国新发现的化石样品。其中一个样品来自德国贺斯亥茵，属于距今7000多年的年早期新时期时代；另外一个样品来自德国樱桃树洞穴，属于距今4700年的晚期新时期时代。对两个样品的基因组进行测序之后，科研人员发现，这两个样品的基因组和现代狗的基因组有着高度的同源性。也就是说，经过7000多年的时间，遗传信息很好的从狗的祖先（化石标本）延续到了现代的狗的身上。
左：德国贺斯亥茵狗化石样品中的颞骨；右：德国樱桃树洞穴狗化石样品中的头盖骨。
所以科学家们推测，生活在欧洲的狗只有一个起源，而不是之前说的两个起源。实验人员还推测，狼和狗大约是在4万年前出现的分化。而距今2万年前，出现了生活在欧亚大陆东端和西端的狗的分化。
通过将爱尔兰和德国发现的化石样品与全世界的狗化石样品比较，科学家发现欧洲的化石样品在基因组层面有很高的相似性。7000多年的时间里，狗祖先的基因得到了很好的传递。
虽然还是不知道狗到底是什么时候从狼分化出来，但是，随着测序技术的进步，随着全世界更多化石样品被发现，科学家一定会越来越接近问题的真相。
（来源：果壳网）