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新三板转板制度确立的当晚，市场基础建设也在推进。
6月3日晚间，全国中小企业股份转让系统（简称股转系统）公告称，目前首批新三板公募基金产品注册已获证监会同意注册，华夏基金、南方基金、汇添富基金、富国基金、万家基金和招商基金等6只基金公司夺得头筹。另据了解，工银瑞信基金等基金公司的相关新三板基金产品也在排队审查程序中。
此前公募基金产品并不能直接投资新三板市场，仅可以通过专户产品形式参与，相关投资者最低认购金额也达到100万元，实质上仍属于私募产品。“公募基金进入新三板，可以说是市场呼吁多年的政策，”有新三板市场从业人员表示，“解决流动性问题，大家就都可以投了。”
而在4月17日，证监会正式发布《公开募集证券投资基金投资全国中小企业股份转让系统挂牌股票指引》，4月20日，就有多家基金公司上报了可以投资新三板的基金产品。
根据《指引》的要求，新三板基金产品的管理人应具备相应投研能力，配备充足的投研人员。因此首批获准设立公募基金产品的试点公司，普遍为市场投研能力较好的头部基金公司。其中华夏基金、南方基金、汇添富基金等4家基金公司还是首批获批设立科创板基金的管理人。
根据《指引》的要求，新三板基金产品的管理人应具备相应投研能力，配备充足的投研人员。因此首批获准设立公募基金产品的试点公司，普遍为市场投研能力较好的头部基金公司。其中华夏基金、南方基金、汇添富基金等4家基金公司还是首批获批设立科创板基金的管理人。
股转系统表示，新三板公募基金产品获批，标志着新三板改革措施中“引入公募基金等中长期资金”正式落地实施。一方面，将使得一部分尚不符合新三板投资者适当性管理要求的普通投资者可以通过购买公募基金的形式参与新三板市场，为投资者提供分享优质创新创业型企业成长红利的机会；另一方面，将为公募基金拓宽投资范围，推动管理人发挥专业管理能力，支持国家创新发展战略。
此外，首批新三板公募基金产品的及时获批，将带来增量社会资金参与新三板公开发行，对于提高市场交易活跃度，稳定市场发展预期，确保新三板公开发行成功落地发挥积极作用。
数据显示，截至2020年6月3日，已有近50家公司申报精选层，股转系统则受理了其中47家企业公开发行股票并在精选层挂牌的申请，并向其中36家企业出具了问询意见。另一方面，除首批推出的6只公募产品外，市场合格投资者也已超100万户。