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9月10日，埃及總統穆爾西（右）在開羅會見到訪的西班牙外交大臣加西亞-馬加略。
分析人士認為，雖然受積弊及其他多方因素掣肘，莫爾西旨在改善民生和解決經濟問題的“百日計畫沒有全面實現，但還是取得了不錯成績。總體看，莫爾西的百日執政有喜有憂。
民生：“百日計畫穩步推進
“百日計畫是莫爾西在競選總統期間提出的針對埃及社會長期問題的解決方案，涉及安全、能源、環境衛生、食品補貼和交通五大類的６４項議題。
莫爾西６日在開羅體育場對參加“十月六日戰爭（即第四次中東戰爭）紀念活動的埃及民眾說，政府已完成“百日計畫中安全目標的７０％，目前在西奈半島開展的清剿武裝分子行動將持續下去，以保障這一地區居民安全。
莫爾西說，在解決燃料短缺方面，政府已完成計畫目標的７５％，今後還將為該計畫提供１６４．１億美元的燃油專項預算。在環境衛生、食品補貼及交通方面，政府分別完成了計畫目標的４０％、８０％和６０％。
開羅大學政治系教授穆罕默德·邵基認為，莫爾西就任總統百日以來的表現總體積極，民眾在安全方面能夠感覺到明顯改善，能源、環境衛生和交通等方面也有進步，但１００天時間對於解決埃及沉屙來說遠遠不夠。
開羅尼羅河政策研究中心研究員艾哈邁德班認為，莫爾西的表現距離民眾預期還有一定距離，“用１００天來解決埃及複雜的經濟與社會問題是不現實的。他對政府的能源專項補貼計畫表示擔憂，認為長期提供高額補貼會加大財政赤字。
政治：有突破存隱患
在積極推行“百日計畫以爭取民眾支持的同時，莫爾西及其背後的穆斯林兄弟會（穆兄會）也花費了大量精力與各政治派別展開博弈，通過一系列措施逐步鞏固自身地位。
就職三周後，莫爾西任命看守內閣灌溉與水資源部長、獨立人士甘迪勒出任總理，負責組建內閣，由此邁出執政第一步。
就職六周後，西奈半島發生士兵遇襲事件，莫爾西借機迫使執掌國家權力一年有餘的國防部長坦塔維和武裝部隊參謀長阿南下台，並廢除軍方頒佈的嚴格限制總統職權的臨時憲法聲明，從而有效鞏固了自身權力。
就職九周後，穆兄會在新內閣中爭取到４個部長職位，並在一些關鍵職位上成功安排了多名認同穆兄會理念、與其有千絲萬縷聯繫的人選，進一步加強了己方陣營。
不過，一些分析人士認為，莫爾西執政百日來雖在政治領域成績顯著，但也難言高枕無憂。
首先，制憲問題懸而未決。開羅大學教授邵基認為，如果莫爾西和穆兄會不能在近期就憲法制定問題與各派達成一致，那麼制憲過程中的拖延和紛爭以及由此而來的輿論壓力將會對他們造成負面影響，進而拖累穆兄會在即將舉行的新人民議會選舉中的表現。
其次，雖然莫爾西在宣誓就職時一再強調自己是“全體埃及人的總統，但綜觀過去１００天內的表現，莫爾西沒能化解國內科普特人對自身可能遭到“邊緣化的擔憂，而且穆斯林和科普特人間的關係還出現諸多波折。
第三，穆兄會與盟友薩拉菲派關係出現裂痕。艾哈邁德班告訴記者，穆兄會曾許諾將宗教事務部交給薩拉菲派，但卻未兌現諾言，這引發後者不滿。另外，目前薩拉菲派內部派別正在相互爭權，導致該派影響力和凝聚力有所下降。在未來的議會選舉中，該派是否會與穆兄會並肩作戰、能否為其提供足夠支援尚不得而知。
外交：尋求積極轉變
外交方面，莫爾西在上臺後的１００天內連續出訪了沙特、中國、伊朗、土耳其等國，出席了非洲聯盟首腦會議、不結盟運動首腦會議和聯合國大會。開羅大學教授邵基認為，莫爾西的外交政策總體上是積極的，“可以真切感受到埃及在外交方面的轉變。
邵基說，莫爾西出訪目的明確，與前總統穆巴拉克相比更加務實。比如，莫爾西希望通過對沙特和土耳其的訪問確保兩國對埃及的援助，以使埃及能夠渡過當前的經濟難關。同時，他還在努力改變穆巴拉克時代一味追隨美國的姿態，出席在伊朗首都德黑蘭舉行的不結盟運動首腦會議，成為埃及和伊朗兩國斷交以來首位到訪伊朗的埃及國家元首。他所倡議的“敘利亞問題聯絡小組也邀請伊朗參與。這些都是埃及在外交上擺脫對美國依賴、重塑地區大國形象的重要嘗試。
艾哈邁德班認為，莫爾西選擇中國而非傳統西方盟國美國作為他訪問的首個非阿拉伯國家，表明他希望與包括中國在內的新興市場國家增進聯繫，進而尋求新的外交戰略平衡點。