新華社鄭州9月26日電(記者李亞楠)26日,洛陽農林科學院和深圳華大基因農業控股有限公司共同召開新聞發佈會宣佈,中國科學家在世界上首次成功破譯牡丹基因組,填補了芍藥科植物基因組研究空白。
據深圳華大農業應用研究院院長董揚介紹,牡丹基因組的破譯,在國際植物基因組研究上填補了芍藥科植物基因組的空白,在牡丹研究方面具有里程碑意義。
董揚說,此次破譯取得了三項世界領先。首次完成了牡丹基因組精細圖的繪製,使“數字化牡丹”精彩呈現。完成牡丹基因組組裝大小12.25GB,拼接片段Contigs N50=128KB,基因組完整度98%,雙端比對率98.8%,錨定染色體85%的基因組精細圖譜,實現了超大基因組三代測序技術的完美組裝。
首次註釋了65898個牡丹基因,使“定制化牡丹”成為可能。獲取了包含牡丹花形、花色控制基因及與牡丹籽油合成相關的基因,為精準化牡丹分子育種提供了技術支撐。
首次構建了牡丹基因組及表型數據庫,使“信息化牡丹”觸手可及。依託研究成果建設了牡丹基因組數據庫,涵蓋1000餘份牡丹品種資源,從基因視野對牡丹進行分類、甄別,實現大數據查詢應用。
據介紹,基於此項研究成果,可以更加科學地做好牡丹品種資源的溯源、保護工作,可以實現牡丹精準定向分子育種,可以加快牡丹產業化發展。
據了解,牡丹基因組極其複雜,達12.5GB(約是人類基因組的4.5倍)。2014年12月,洛陽市政府、深圳華大基因簽署協議,共同開展洛陽牡丹基因組學研究。雙方經過近三年的協作攻關,動用了包括銀河超算在內的各種科研資源,應用世界最先進的第三代測序技術,在世界上首次破譯了牡丹基因組。(完)
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